野村和哉

星野良太 arrow_blank.PNG 霞知世
所属豊橋技術科学大学
情報・知能工学専攻
学年修士課程2年
E-mail
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研究テーマ

  • 分子シミュレーションによるカタボライト活性化タンパク質と環状AMP及びDNA間の特異的相互作用の解析
  • 様々な糖とアミロイドβタンパク質間の特異的結合特性: 高精度分子シミュレーションを用いた解析
  • 第一原理分子軌道計算によるDNA塩基対の異性化反応の遷移状態の探索

研究業績

国際学術雑誌に発表した論文

  1. "Effect of D23N mutation on the dimer conformation of amyloid β-proteins: ab initio molecular simulations in water",
    A. Okamoto, A. Yano, K. Nomura, S. Higai, N. Kurita,
    Journal of Molecular Graphics and Modelling, 2014, 50, 113-124.
  2. "Difference in dimer conformation between amyloid-β (1–42) and (1–43) proteins: replica exchange molecular dynamics simulations in water",
    A. Yano, A. Okamoto, K. Nomura, S. Higai, N. Kurita,
    Chemical Physics Letters, 2014, 595, 242-249.
  3. "Stable conformation of full-length amyloid-β (1-42) monomer in water: replica exchange molecular dynamics and ab initio molecular orbital simulations",
    A. Okamoto, A. Yano, K. Nomura, S. Higai, N. Kurita,
    Chemical Physics Letters, 2013, 577, 131-137.
  4. "DFT study on reaction mechanism of DNA base pair with hydroxyl radical",
    E. Shimizu, R. Hoshino, K. Nomura, V. I. Danilov, N. Kurita,
    Journal of Modern Physics, 2013, 4, 442-451.
  5. "DFT calculations on the effect of solvation on the tautomeric reactions for wobble Gua-Thy and canonical Gua-Cyt base-pairs",
    K. Nomura, R. Hoshino, E. Shimizu, Y. Hoshiba, V. I. Danilov, N. Kurita,
    Journal of Modern Physics, 2013, 4, 422-431.
  6. "Proposal for an inhibitor of Alzheimer's disease blocking aggregation of amyloid-β peptides: ab initio molecular simulations",
    A. Okamoto, K. Nomura, A. Yano, S. Higai, T. Kondo, S. Kamba, N. Kurita,
    Journal of Physics Conference Series, 2013, 43, 012033.
  7. "Effect of BrU on the transition between wobble Gua-Thy and tautomeric Gua-Thy base-pairs: ab initio molecular orbital calculations",
    K. Nomura, R. Hoshino, Y. Hoshiba, V. I. Danilov, N. Kurita,
    Journal of Physics Conference Series, 2013, in press.
  8. "Ab initio molecular simulations on specific interactions between amyloid beta and monosaccharides",
    K. Nomura, A. Okamoto, A. Yano, S. Higai, T. Kondo, S. Kamba, N. Kurita,
    Chemical Physics Letters, 2012, 547,89-96.

国内の学術雑誌に発表した論文

...No achievement found.

国際学会における発表

  1. "DFT study on the tautomeric reactions for wobble Gua-Thy and canonical Gua-Cyt base-pairs",
    K. Nomura, R. Hoshino, Y. Hoshiba, V. I. Danilov, N. Kurita,
    3rd AICS International Symposium, 2013, Feb. 28-Mar. 1, Kobe, Japan.
  2. "Effect of BrU on the isomerization reaction between wobble Gua-Thy and tautomeric Gua-Thy base pairs: ab initio MO calculations",
    K. Nomura, R. Hoshino, Y. Hoshiba, V. I. Danilov, N. Kurita,
    AP-IRC 2012, 2012, November 15-16, Tahara, Japan.
  3. "Ab initio molecular simulations on specific interactions between amyloid-β and sugars: a proposal of novel sugars applicable to biosensors for Alzheimer’s disease ",
    K. Nomura, A. Okamoto, A. Yano, S. Higai, T. Kondo, S.Kamba, N. Kurita,
    TACC-2012, 2012, September 2-7, Pavia, Italy.

国内学会における発表

  1. "第一原理分子軌道計算によるDNA塩基対の異性化反応の遷移状態の探索"
    野村和哉, 干場靖浩, Victor I. Danilov, 栗田典之,
    第6回分子科学討論会, 2012, 東京都.
  2. "様々な糖とアミロイドβタンパク質間の特異的結合特性:高精度分子シミュレーションを用いた解析 ",
    野村和哉, 岡本晃澄, 矢野篤志, 檜貝信一, 近藤孝志, 神波誠治, 三浦佳子, 栗田典之,
    神戸大学先端融合科学シンポジウム, 2012, 兵庫県.
  3. "アミロイドβタンパク質と単糖間の特異的結合特性の解析:古典分子力学及びフラグメント分子軌道計算",
    野村和哉,岡本晃澄,矢野篤志,檜貝信一,近藤孝志,神波誠治,三浦佳子,栗田典之,
    第25回分子シミュレーション討論会, 2011, 東京都.
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